I. Административно-управленческий аппарат

1. Дирекция
   • Директор
   • Заместитель директора по общим вопросам
   • Руководитель научного направления
   • Ученый секретарь
   • Секретарь директора
2. Бухгалтерия
3. Планово-экономический отдел (ПЭО)
4. Отдел кадров (ОК)
5. Хозяйственная служба

II. Научно-исследовательские подразделения

1. Отдел информатизации, математического моделирования и управления
2. Отдел математических методов автоматизации проектирования
3. Отдел вычислительных методов и турбулентности

III. Общеинститутские подразделения

1. Отдел администрирования и технического сопровождения информационных систем

IV. Вспомогательные подразделения

1. Группа по обслуживанию зданий и сооружений

Структура утверждена Ученым советом Института (протокол № 4 от 19 апреля 2018г.)